F@H. Τι, πως και γιατί.

**The Lab** · 16-09-03, 14:04

Δύο λόγια στα Ελληνικά(μιας και τα links που θα παραθέσω είναι ξενόγλωσσα), σχετικά με το τι είναι το F@H, και γιατί αξίζει να δαπανήσουμε την μη χρησιμοποιούμενη επεξεργαστική ισχύ του υπολογιστή μας.

Τι είναι οι πρωτεϊνες και γιατί διπλώνονται; Οι πρωτεϊνες είναι η κινητήρια μηχανή πίσω από την βιολογία - είναι "νανομηχανές". Πρωτού οι πρωτεϊνες επιτελέσουν την βιοχημική λειτουργία τους, συναρμολογούνται ή "διπλώνονται". Η διαδικασία του διπλώματος της πρωτεϊνης, παρόλο που είναι σημαντικότατη και θεμελιώδης πρακτικά σε όλους τους κλάδους της βιολογίας, παραμένει μυστήριο. Επιπλέον, όταν οι πρωτεϊνες δεν συναρμολογηθούν σωστά, οι συνέπειες είναι σοβαρότατες. Μερικές από τις συνέπειες αυτές περιλαμβάνουν γνωστές ασθένειες, όπως Alzheimer, Νόσο των τρελλών αγελάδων (BSE), CJD, ALS, και Parkinson.

Τί είναι το F@H Project; To Folding@Home είναι ένα project όπου με την βοήθεια ενός μικρού software, χρήστες υπολογιστικών συστημάτων σε όλο τον κόσμο βοηθούν στην μελέτη και κατανόηση του "διπλώματος" των πρωτεινών, των συνεπειών που έχει η μη ορθή συναρμολόγησή τους καθώς και των σχετικών ασθενειών. Χρησιμοποιούνται καινοφανής και μεγάλης κλίμακας κατανεμημένες υπολογιστικές μέθοδοι προκειμένου να προσωμοιωθούν οι χρόνοι και οι λειτουργίες των πρωτεϊνών... Αυτό έχει επιτρέψει στους ερευνητές να προσωμοιώσουν το "δίπλωμα" για πρώτη φορά και να εξετάσουν ασθένειες σχετικές με αυτό.

Τελικά, τι είναι το F@H;

Κατεβάστε το client software

Κεντρική Σελίδα του Standford

Aποτελέσματα, και τι ακριβώς πετυχαίνουν οι προσπάθειές μας

Νέα σχετικά με F@H, betas, κλπ.

Οι πόντοι μεμονωμένων πρωτεϊνών

Φόρουμς σχετικά με F@H

Στατιστικά Ομάδων του F@H

Συνολικές Βαθμολογίες Ομάδων

Στατιστικά της Ομάδας#32378 - TheLab.gr

Ενημερωτικά, το tech report αναλύει πότε και πόσο επηρεάζει ο client του F@H τις επιδόσεις του συστήματος μας, εδώ.

**ΓιαγκΤ** · 25-09-03, 04:47

Εκείνο που πρέπει να προσθέσω εγώ, είναι ότι το σταμφορτ είναι ένα από τα πλουσιότερα πανεπιστήμια στις ηνωμένες. Χρηματοδοτείτε από πολυεθνικές και μεταξύ αυτών φαρμακοβιομηχανίες.
Πράγματι η επεξεργασία πρωτεϊνών είναι μια πολύ χρήσιμη πράξη που θα βοηθήσει την ανθρωπότητα. Πατενταρισμένες από φαρμακοβιομηχανίες όμως, μόνο το πλούσιο τμήμα της θα βοηθήσει.
Γιατί να μην βρείτε κάτι άλλο; Γιατί, αυτό «ξέρουμε» αυτό κάνουμε. Δέστε το σαν πρόκληση να πρωτοτυπήσετε.

.38-.45 · 25-09-03, 09:33

Παράθεση:

Originally posted by ΓιαγκΤ
Γιατί, αυτό «ξέρουμε» αυτό κάνουμε. Δέστε το σαν πρόκληση να πρωτοτυπήσετε.

πως το εννοεις αυτο;

Paxx · 25-09-03, 10:10

Μήπως εννοεί κάτι καινούργιο/διαφορετικό, εκτός απο τα seti & f@h? Yπάρχουν και άλλα?

**ΓιαγκΤ** · 25-09-03, 11:56

Παράθεση:

Originally posted by .38-.45 on 25-09-2003 at 10:33
πως το εννοεις αυτο;

Καλοπροαίρετα.
ΥΓ. Το Foundation τι είναι;

**ΓιαγκΤ** · 25-09-03, 12:00

Παράθεση:

Originally posted by Paxx on 25-09-2003 at 11:10
Μήπως εννοεί κάτι καινούργιο/διαφορετικό, εκτός απο τα seti & f@h? Yπάρχουν και άλλα?

Έχω διαβάσει ότι υπάρχουν. Το κακό είναι ότι δεν μπορώ να ψάξω εξαιτίας της γλώσσας.

.38-.45 · 25-09-03, 20:12

Παράθεση:

Originally posted by ΓιαγκΤ on 25-09-2003 at 12:56
ΥΓ. Το Foundation τι είναι;

The Foundation

στίχος κατά τα αλλά..

Φυσικά και υπάρχουν και αλλά τέτοια προγράμματα (distributed computing). Απλά το F@H παρουσιάζει τον περισσότερο ανθρωπιστικό χαρακτήρα από τα υπόλοιπα.

Spyrus · 28-09-03, 14:10

Θα συμφωνήσω το fah αγγίζει περισσότερο το ανθρωπιστικό μας κομμάτι.

Τώρα τι να πεις για εξωγήινους και πράσινα άλογα....

Stratos · 28-09-03, 15:55

Ας μην ξεχναμε ομως οτι το σετι ανοιξε την πορτα......

dfragos · 28-09-03, 16:09

To Folding το διαλέγετε μάλλον επειδή υπάρχει ήδη κάποια εμπειρία και χρησιμοποιείται και από άλλους. Εγώ θα συμφωνούσα να υπάρξει συμμετοχή σε κάποια άλλη ομάδα. Όχι μασιμένο φαγητό... ’λλωστε μην γελιόμαστε, δεν πάμε να βοηθήσουμε την ανθρωπότητα αλλά για να πάρουμε μια καλή θέση...

.38-.45 · 28-09-03, 16:32

Καθένας διαλέγει το project που επιθυμεί να συμμετάσχει, για τους λόγους που αυτός γνωρίζει. Εμείς αυτό κάναμε εδώ και καιρό (κάποιοι κοντά στα 2 χρόνια, μπορεί και περισσότερο) και αυτό προτείνουμε. Κι όταν σε όλο αυτό το χρονικό διάστημα, έχεις αλλάξει διάφορες ομάδες, οι λόγοι που το κανείς είναι διαφορετικοί από τη βαθμοθηρία.

Δεν έχει συζητηθεί ακόμα κάποιο άλλο project, αν και δε νομίζω ότι υπάρχει θέμα.

Οποίος έχει τις γνώσεις, την εμπειρία και την όρεξη να οργανώσει μια ομάδα, είναι καλοδεχούμενος να το κάνει.

**ΓιαγκΤ** · 28-09-03, 20:13

Με ενδιαφέρει πολύ να μάθω αυτούς τους διαφορετικούς λόγους, αρκεί να είναι τεκμηριωμένοι. Για να γίνω σαφέστερος ο Spyrus μιλάει για ανθρωπισμό. Πως υλοποιείτε αυτός σε μια χώρα που όλα είναι ιδιωτικά στον βωμό του κέρδους; Πως φτάνει στον φουκαρά πάσχοντα στην Γκάνα το φάρμακο της πολυεθνικής που έγινε με την δική σας βοήθεια;
Μακάρι να με διαψεύσετε αλλά νομίζω ότι εθελοτυφλούμε.

**DJD** · 28-09-03, 21:38

Παράθεση:

Originally posted by ΓιαγκΤ
Μακάρι να με διαψεύσετε αλλά νομίζω ότι εθελοτυφλούμε.

Πιθανόν ναι.. αλλά από το να ψάχνω υποτίθεται εξωγήινους.. η εκδοχή του ανθρωπισμού με βολεύει..

.38-.45 · 28-09-03, 21:58

Παράθεση:

Originally posted by ΓιαγκΤ on 28-09-2003 at 21:13
Πως υλοποιείτε αυτός σε μια χώρα που όλα είναι ιδιωτικά στον βωμό του κέρδους; Πως φτάνει στον φουκαρά πάσχοντα στην Γκάνα το φάρμακο της πολυεθνικής που έγινε με την δική σας βοήθεια;

κι εγώ θα ήθελα απαντήσεις σε όλα αυτά..

λάθος ή σωστό, καθένας διαλέγει σε κάτι να πιστεύει. Μπορεί να είναι κάτι αυτό το πρόγραμμα, μπορεί να είναι και μούφα. Επεκτείνοντας το σκεπτικό σου, δεν μπορείς να είσαι για τίποτα σίγουρος, ξεκινώντας από ανθρωπιστικές οργανώσεις μέχρι εκεί που μπορεί να φτάσει το μυαλού σου.

Πέρα από όλα τα αλλά, είναι ο μοναδικός λόγος για να δικαιολογήσω στο εαυτό μου την ύπαρξη του pc, των αναβαθμίσεων και του πάγιου κόστους, το οποίο έχει καταλήξει να γίνει.

Spyrus · 28-09-03, 22:20

Αποψή μου είναι ότι οποιοδήποτε από αυτού του είδους τις ενέργειες είναι ένα δίκοπο μαχαίρι.

Για παράδειγμα οι πρωτεΐνες μπορεί να χρησιμοποιηθούν τόσο για φάρμακα όσο και για χημικά.

Αλλά πάντα ελπίζω ότι θα γίνει για καλό σκοπό. Πείτε μου ότι είμαι ονειροπόλος, ρομαντικός, ότι εθελοτυφλώ. Έτσι μου αρέσει να ζω όμως, είμαι αισιόδοξος εκεί που όλοι απαισιοδοξούν.

Αν σκεφτόμουνα αντίθετα θα είχα ήδη δέσει μια πέτρα στο λαιμό μου και θα έπεφτα στη θάλασσα. Η ελπίδα δίνει νόημα στη ζωή.

Πολύ μελό το έκανα...τέλος πάντων φολντάρετε όσο μπορείτε

lefterhs · 28-09-03, 22:47

Δυστυχως απο τη στιγμη που για να γινει μια σοβαρη ερευνα για αυτες τις ασθενειες χρειαζονται εκατομμυρια $, οι εταιρειες που τις αναλαμβανουν θα περιμενουν οχι μονο να αποσβεσουν αυτες τις μεγαλες επενδυσεις αλλα να βγαλουν και κερδος, ειτε γινεται στα δικα της εργαστηρια ειτε στα πανεπιστημια που επιχορηγουν. Δεν υπαρχει μη κερδοσκοπικος οργανισμος σε τετοιο επιπεδο ερευνας απο τον οποιο να περιμενεις θεραπειες. Εγω βλεπω την προσφορα των χιλιαδων ανθρωπων που αφιερωνουν καποιο απο το χρονο τους στο folding σαν το ανθρωπιστικο μερος της ολης προσπαθειας.

Και ας μην τα ισοπεδωνουμε ολα, ειναι και θεμα κουλτουρας καθε εταιρειας. Ακουσα μια ιστορια, χωρις πολλες λεπτομεριες, στο πανεπηστημιο που ειμαι τωρα, ισως ειναι αληθινη ισως οχι.
Μια πολυεθνικη φαρμακευτικη εταιρεια ηταν προθυμη να διαθεσει δωρεαν τεραστιες ποσοτητες φαρμακου στον ΟΗΕ για μια ασθενεια που μαστιζε την Αφρικη. Ο ΟΗΕ αρνηθηκε, γιατι τα κοστη μεταφορας και διανομης τους ηταν παρα πολυ μεγαλα. Η εταιρεια αυτη τελικα καλυψε και αυτα τα εξοδα και εκανε τη διανομη.

Spyrus · 28-09-03, 23:44

ΟΚ νόμιζα ότι δε θα ενοχλούσε ...

**ΓιαγκΤ** · 29-09-03, 00:07

Δεν απαξίωσα τα πάντα. Απλά μίλησα για το σταμφορτ και την σύνδεση του με τις πολυεθνικές. Κάνω ότι μπορώ να σας αποτρέψω να βοηθήσετε ένα από τα δώδεκα κολέγια της δάφνινης λεγεώνας που για σπουδές μόνο το κάθε «φτωχαδάκι» πληρώνει 30000$-40000$ το χρόνο.
Εδώ έχω δύο εναλλακτικές. Το ημικρατικό της Οξφόρδης (Ευρωπαϊκό γαρ) και το μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα του Καναδά. Είναι αρκετά καλύτερες λύσεις.

http://www.chem.ox.ac.uk/curecancer.html

http://www.distributedfolding.org/

ΥΓ Τα εγγλέζικα μου είναι ανύπαρκτα. Αυτά που βρήκα είναι άθλος για μένα. Όποιος θέλει βρίσκει, δεν είναι απαραίτητο να ψάχνει για εξωγήινους

Fireblade · 29-09-03, 04:32

Παράθεση:

Originally posted by lefterhs
Και ας μην τα ισοπεδωνουμε ολα, ειναι και θεμα κουλτουρας καθε εταιρειας. Ακουσα μια ιστορια, χωρις πολλες λεπτομεριες, στο πανεπηστημιο που ειμαι τωρα, ισως ειναι αληθινη ισως οχι.
Μια πολυεθνικη φαρμακευτικη εταιρεια ηταν προθυμη να διαθεσει δωρεαν τεραστιες ποσοτητες φαρμακου στον ΟΗΕ για μια ασθενεια που μαστιζε την Αφρικη. Ο ΟΗΕ αρνηθηκε, γιατι τα κοστη μεταφορας και διανομης τους ηταν παρα πολυ μεγαλα. Η εταιρεια αυτη τελικα καλυψε και αυτα τα εξοδα και εκανε τη διανομη.

Μην πιστεύεις ό,τι ακούς φίλε. Δεν υπάρχει θέμα κουλτούρας στις εταιρείες. Σκοπός της εταιρείας είναι ΠΑΝΤΑ και ΜΟΝΟ το κέρδος και δε δίνει τίποτα για την ψυχή της μάνας.

BillyVan · 07-10-03, 23:12

Παράθεση:

Αρχική απάντηση από Fireblade
Μην πιστεύεις ό,τι ακούς φίλε. Δεν υπάρχει θέμα κουλτούρας στις εταιρείες. Σκοπός της εταιρείας είναι ΠΑΝΤΑ και ΜΟΝΟ το κέρδος και δε δίνει τίποτα για την ψυχή της μάνας.

Μαζι σου Τσε.